Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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