Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM8A1Q9UBU6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms