Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms