Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms