Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms