Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms