Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms