Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms