Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms