Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms