Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN4Q9NRL3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms