Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSU72Q9NP77 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms