Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms