Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms