Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRNKL1Q9BZJ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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