Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms