Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLVAPQ9BX97 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms