Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA5Q9BWX5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms