Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP8Q9BV40 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms