Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPOQ9BU64 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms