Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms