Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms