Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms