Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms