Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms