Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS8Q99627 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms