Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms