Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms