Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms