Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms