Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC74BQ96LY2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms