Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC17Q96LX7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms