Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms