Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP47Q96K76 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms