Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms