Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms