Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED3Q96IU2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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