Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCTD12Q96CX2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms