Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NXNL1Q96CM4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms