Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NEIL2Q969S2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms