Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms