Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms