Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CSNK2A3Q8NEV1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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