Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms