Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNTD1Q8N9Z9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms