Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF182Q8N6D2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms