Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TTC9CQ8N5M4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TTC9CQ8N5M4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC9CQ8N5M4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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