Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVOPQ8N4V2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms