Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSX7Q7RTT5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSX7Q7RTT5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms