Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM47EQ6ZV65 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms